查理五世选择主动退位的原因主要有以下几点：
- 健康问题：查理五世晚年健康状况不佳，这影响了他的统治能力1。
- 政治压力：他在新教和天主教之间的宗教战争中感到疲惫，尤其是在1555年在击溃新教诸侯的最后努力失败后，他开始淡出朝政2。
- 领土管理困难：查理五世认为他的领土太过广大且分散，管理起来十分困难，再加上欧洲其他国家对于均势的追求，以至于各方势力难以平衡3。
- 精神和宗教因素：查理五世可能出于对宗教和精神生活的追求，希望在余生中专注于宗教活动4。
至于他的领土分配，查理五世将领土主要分为两部分：
- 西班牙和低地国家：他将这些地区交给了儿子腓力二世（Philip II of Spain）5。
- 神圣罗马帝国以及其他哈布斯堡王朝的领地：这部分则交给了他的弟弟斐迪南一世（Ferdinand I, Holy Roman Emperor）6。
通过这样的分配，查理五世确保了哈布斯堡王朝的势力得以延续，同时也使得他可以安心退位，专注于个人的宗教生活。