曼科·印卡未能成功攻克库斯科的原因主要有以下几点：
内部支持不足：曼科·印卡并没有得到所有臣民的完全支持。一些地方首领和臣民对曼科·印卡的领导持怀疑态度，这削弱了他的军事力量和政治影响力。
士气和武器劣势：曼科·印卡的军队士气低落，且他们的武器装备不如西班牙人先进。这使得他们在与西班牙军队的战斗中处于劣势。
西班牙人的防御和战术：西班牙人在库斯科的防御坚固，并且他们采取了有效的战术来抵御印加军队的攻击。例如，他们利用了印加军队对马匹和火器的不熟悉。
西班牙的内部矛盾：尽管西班牙人之间存在不和，但曼科·印卡未能有效利用这一点。他试图从弗朗西斯科·皮萨罗和迭戈·德·阿尔马格罗的不和中获益，但最终未能成功。
长期围攻的失败：曼科·印卡对库斯科进行了长达十个月的围攻，但最终未能攻克该城，导致他不得不放弃计划。
以上信息参考自维基百科关于西班牙征服印加帝国的条目[1]，以及关于曼科·印卡·尤潘基的条目[2]。这些历史事件表明，曼科·印卡未能成功攻克库斯科是多方面因素共同作用的结果。