卢梭认为科西嘉岛的首都不应建立在巴斯蒂亚港口，而是应该远离海岸，主要基于以下几点理由：
反对城市特权：卢梭主张城市及其居民不应拥有任何特权，全岛都应平等享受权利、承担义务。他认为首都的设立不应偏袒某个城市或地区，而应促进全岛的均衡发展1。
避免民族深渊：卢梭认为“一个首都就是一个深渊，整个民族在其中消失”。他担心首都的集中会导致权力和资源的过度集中，从而损害科西嘉岛的整体利益和民族特色2。
鼓励岛内商贸和农业：卢梭并不反对贸易，而是鼓励科西嘉人在岛内恢复商贸往来，在利于耕种的土地上从事农业，而在沼泽和干地上从事手工业。他希望科西嘉岛能够自给自足，减少对外部的依赖1。
战略和安全考虑：卢梭可能还考虑到了战略和安全的因素，远离海岸的首都不易受到外来侵略的直接威胁，有助于保护岛屿的安全和稳定1。
综上所述，卢梭的这些观点体现了他对科西嘉岛社会、经济和政治发展的深刻洞察，以及对岛屿未来命运的深思熟虑。