阿马尔菲共和国在11世纪终结的原因主要有以下几点：
外部势力的入侵：根据搜索结果中的维基百科条目“海上共和国”[1]，阿马尔菲在1137年被比萨人洗劫，当时它因自然灾害（严重洪水）而衰弱。此外，阿马尔菲在1130年作为诺曼领袖的西西里国王罗杰二世以武力胁迫将阿马尔菲纳入自己的统治[2]，导致这个商业共和国失去了至关重要的外交自主权。
内部起义与镇压：在1096年阿马尔菲起义并恢复为独立共和国，但于1101年被镇压。1130年再次起义，最终于1131年被平息[1]。
自然灾害的影响：阿马尔菲因自然灾害（严重洪水）而衰弱，这使得外部势力更容易入侵和控制该地区[1]。
经济与政治的变迁：在10世纪和11世纪，阿马尔菲逐渐发展成为一个经济强国，一个商业中心，其商人在9世纪和10世纪主导了地中海和意大利的贸易，直到比萨和威尼斯等其他海上共和国的崛起[3]。
这些因素共同导致了阿马尔菲共和国在11世纪的终结。引用来源如下： [1] https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E6%B5%B7%E4%B8%8A%E5%85%B1%E5%92%8C%E5%9B%BD [2] https://www.sohu.com/a/431803647_120892726 [3] https://zh.wikipedia.org/zh-cn/%E9%98%BF%E9%A9%AC%E5%B0%94%E8%8F%B2%E5%85%AC%E5%9B%BD