在11至12世纪，军区制在拜占庭帝国经历了以下重大变化：
军区制的瓦解：根据中国历史研究院的文章，11世纪时，军区制开始瓦解，导致帝国走向衰落。拜占庭帝国土地关系述评 - 中国历史研究院
军事将领插手皇族内部斗争：维基百科提到，由于多次发生军事将领插手皇族内部斗争的情况，巴西尔二世之后的历任皇帝开始解散军区和世袭制度。东罗马帝国- 维基百科
农民及军农沦为依附农：中国经济网的文章指出，在农村，生活在广大军事地产上的农民及相当一部分下级军农，多已沦为大地主的依附农（在拜占庭时期，他们被称为“巴力克”），军区制趋于瓦解。拜占庭的历史分期与早期拜占庭 - 中国经济网
雇佣兵控制权的丧失：中国历史研究院的文章提到，12世纪的帝国军事制度经历了深刻的变化，其中最重要的表现便是雇佣兵控制权的丧失。晚期拜占庭帝国雇佣兵控制权的丧失及其影响 - 中国历史研究院
这些变化反映了军区制在拜占庭帝国的衰落和转型，以及军事和社会结构的深刻变动。