圣尼古拉教堂的建筑风格独特之处主要体现在以下几个方面：
木构架井干式构成：圣·尼古拉教堂全部采用木构架井干式构成，这种结构在俄罗斯民间木结构帐篷顶的传统形式中十分常见，使得教堂内部围成巨大的穹顶空间，外部则展现出独特的外观[1]。
俄罗斯古典哥特式风格：教堂的设计源自俄国，以并干式圆木结构为主，展现了俄罗斯古典哥特式的建筑风格。八面体的外形设计使得教堂在周围自然景色的映衬下愈发和谐统一，中央大圆顶成为视觉焦点[3]。
新古典主义立面：圣尼古拉堂拥有新古典主义的立面，出自德国出生的建筑师Matteo Pertsch之手。这种风格使得教堂在视觉上显得更为简洁和优雅[2]。
巴洛克式钟塔：教堂的两侧钟塔是根据奥地利/巴伐利亚巴洛克式教堂的形式设计，为教堂增添了一种庄重和华丽的感觉[2]。
多样风格的融合：不同地区的圣尼古拉教堂展现了不同风格的融合，例如布拉格的圣尼古拉教堂外部为红色巴洛克风格，内部则保持罗马式风格[4]。
尖塔设计：14世纪，圣尼古拉教堂经历了显著的转型，采用当时在欧洲流行的哥特式建筑风格，建造了一座高耸入云的尖塔，成为天际线上的显著特征[11]。
这些独特的建筑风格使得圣尼古拉教堂成为一座具有历史和文化价值的地标性建筑。