在纳粹占领波兰期间，波兰的天主教会经历了一系列重大变化，主要包括：
教会资产的没收与破坏：纳粹占领者关闭了所有高等教育机构，禁止波兰语教学，并掠夺民众财产，包括教会资产。德国企图使波兰西部地区完全德国化，对当地的波兰天主教采取迫害手段，使教会失去法律地位，圣堂和修会会院被查封12。
宗教迫害与神职人员遭受迫害：纳粹占领期间，许多神职人员因反抗纳粹政策而被捕或杀害。据估计，在纳粹占领期间，共有300万波兰犹太人以及180至280万波兰人被纳粹杀害，其中包括许多天主教神职人员34。
教会作为民族凝聚力量的增强：在抗击外国入侵的历次斗争中，天主教都起了巨大的民族凝聚作用。在纳粹占领期间，教会变卖教会资产资助抗击外敌的斗争，成为民族抵抗运动的重要力量5。
教会在拯救犹太人中的作用：在二战和纳粹占领波兰期间，一些波兰天主教徒冒着生命危险藏匿犹太人，展现了教会在拯救生命方面的人道主义努力6。
教会与政治的复杂关系：纳粹占领期间，教会与政治的关系变得复杂。一方面，教会在民族抵抗中发挥了作用；另一方面，教会也面临着与占领者的合作与抵抗之间的道德困境7。
综上所述，纳粹占领期间波兰天主教会不仅在物质上遭受了巨大损失，而且在精神和道德上也面临着严峻挑战。教会在抵抗外敌、保护信徒和拯救犹太人方面发挥了重要作用，同时也经历了与占领者的复杂互动和道德困境。