国立屏东商业技术学院的校徽设计具有以下独特的象征意义：
电路板图案：校徽中的电路板代表着科技，象征着学校对科技发展和应用的重视。它代表着学校优秀的科技教育和专业技术培养，同时也代表着学校对科技创新和产业发展的贡献联合创智。
“山高水长”造型：校徽下方为“山高水长”造型，主要以四本书籍造型为主，四本书籍朝向太阳方向靠拢集中，并与背后的三角形高山背景相叠，比喻“知识如山”以及“科际整合”的意义。如果将四本书籍看作是“四书”，与背后的三角形高山结合，可以联想到古代“四书五经”的意涵，象征着学校深厚的文化底蕴和对知识的追求屏東大學。
圆形太阳与线条：校徽中的一个圆形太阳以及四条细圆弧形线条（1+4=5），更易令人联想到古代“四书五经”的意涵，象征着学校与地区发展的紧密连结，齐头并进校史館。
这些设计元素共同体现了国立屏东商业技术学院的教育理念和精神，即重视科技与知识，追求科际整合，并与地区发展紧密相连。